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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

河北邢台：数字化监督管好农村“三资”账******url:https://m.gmw.cn/2022-12/27/content_1303236049.htm,id:1303236049

　　记者从河北省邢台市农业农村局了解到，今年以来，在对全市农村集体“三资”（资金、资产、资源）进行全面清产核资后，邢台市推出智慧农经综合管理服务平台，设置农村集体产权改革管理、农村宅基地管理、阳光公开等板块，运用数字技术推动农村集体“三资”精细化监管，助力乡村焕发新活力。

　　“洒水车加油，购买中性笔、档案盒，发放居民养老金，向国家缴纳税金，集体收取资产租金，银行存款……这些账单摆在这儿，一目了然。”每到月初，邢台市信都区南大汪村村民温玉君都能在手机上查询到上个月的村集体资金使用明细。温玉君说：“手指点一点，每一笔账都能在线追踪溯源，查到原始合同，我们对村集体的发展更有信心。”

　　“农村集体财务计划、收入、支出、资产、资源、收益分配等情况，大到上亿元的项目建设，小到几元的办公用品，每月的7号前都会在村务公开栏与智慧农经综合管理服务平台同步逐项逐笔公开。”据邢台市农业农村局农村合作经济经营管理站站长冯建清介绍，目前，全市5226个乡村均已实现集体“三资”管理数字化、公开电子化、监督多元化。

　　邢台市平乡县新果寨村村民在手机上查询村集体资金使用明细。（受访单位供图）

　　智慧农经综合管理服务平台推动监督触角向基层延伸，进一步拉近干群关系，提升村级组织带领和服务群众能力。邢台市襄都区东郭村镇南康庄村党支部书记赵建民说：“多途径公开村集体家底后，就像给群众手里发了一册‘账单’，给群众一个明白，给干部一个清白。让数字多跑路，我们就能腾出更多时间为群众办实事。”

　　邢台市农业农村局党组书记邱海飚表示，农村集体“三资”监管需要真正做到部门监管有力、规范管理有效、常态监管有序，才能健康地发展壮大农村集体经济，夯实乡村振兴基础。（记者王昆）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）